Masjid Al Huda setiap hari dimanfaatkan sebagai sarana ibadah bagi siswa maupun bapak ibu guru SMAN 13 Semarang. Dengan kapasitas yang cukup luas menjadikan masjid ini cukup untuk dipakai berbagai kegiatan kerohanian SMAN 13 Semarang. Selain dikelola oleh guru PAI, Masjid Al Huda juga didukung oleh ekstra Rohis dalam pengelolaan berbagai kegiatan kerohanian.